Comme tous les établissements publics de santé (EPS), il est doté d'une autonomie administrative et juridique, dans un cadre normé fixé par l’autorité de tutelle, l’Agence Régionale de Santé de Normandie, notamment pour les activités médicales autorisées.
La conduite de l'établissement est confiée à un directeur général, conseillé par le Directoire, qui regroupe des représentants du corps médical et infirmier et entouré d'une équipe de directeurs adjoints chargés de secteurs particuliers (le personnel, les finances, la qualité, les équipements, les travaux, l'informatique...).
Pour les grandes décisions stratégiques ou budgétaires, le directeur général sollicite la délibération du Conseil de Surveillance, qui s'appuie sur les avis donnés par différentes instances :
Le CHPC est organisé autour de cinq grands pôles d'activités :
Mme Séverine KARRER, directrice
M. Samuel BAUDU-PICQUET
M. Xavier BIAIS
Mme Clémence ROUCAN
Mme Bénédicte GASTEBOIS
Mme Céline DIASCORN
Mme Catherine GOSSELIN
M. Yann TANGUY